Château Clerc Milon is van origine verbonden aan de heerlijkheden Lafite en Mouton (toekomstige Premier (1er) Grand Cru Classé's die tot twee verschillende takken van de familie Rothschild behoren en ontleent zijn naam aan zijn historische eigenaren: de familie Clerc. De familie Clerc verwierf het château toen het na de Franse Revolutie als nationaal bezit werd verkocht. De naam Milon is een verwijzing naar het gelijknamige, naburige gehucht aan de Noord-Westelijke kant van Pauillac en werd in 1850 toegevoegd aan de naam van het wijnhuis. Enkele jaren later, in 1855, ontving Château Clerc Milon tijdens de classificatie van de beste Bordeaux-wijnen haar classificatie als Cinquième Cru (5e Cru). Ruim een eeuw later, in 1970, koopt Baron Philippe de Rothschild, overtuigd van de uitzonderlijke kwaliteit van het terroir, het wijnhuis. Het wijnhuis verkeerde op dat moment in een vervallen staat en zodoende begint Baron Philippe de Rothschild direct met de renovatie om het wijnhuis in ere te herstellen en de ware persoonlijkheid terug te brengen. Circa 40 jaar later zet Barones Philippine de Rothschild het werk van haar vader voort en renoveert alle technische faciliteiten en apparaten om de hoge kwaliteitsnormen te weerspiegelen die het wijnhuis zichzelf stelt. Ook de vatruimte, kelders en zogeheten chai worden gerenoveerd. Sindsdien gaat Château Clerc Milon met haar tijd mee en biedt het constant een uitstekende weerspiegeling van de uitzonderlijke prijs-kwaliteitverhouding die een Cinquième Cru Classé kan bieden.