De geschiedenis van Château Labégorce gaat terug tot de 14e eeuw toen het werd opgericht door de familie La Bégorce. Het domein wordt al vermeld in de Bordeaux-gids Cocks & Féret uit 1868, waarin het domein wordt aangehaald als "het land van het huis van de nobele familie La Bégorce" en wordt omschreven als "één van de mooiste en best gelegen in de gemeente Margaux". Enkele jaren na deze vermelding aan het einde van de 18e eeuw gedurende de Franse Revolutie moet de familie Gorce verplicht het domein verdelen. Deze verdeling zou bijna twee eeuwen stand houden tot de aankoop van het domein door de familie Perrodo, specifieker Hubert Perrodo. Hubert Perrodo is tot op dat moment een bekend zakenman en heeft zijn imperium opgebouwd middels onder meer de olie-industrie. Met de aankoop van het domein heeft hij echter voor ogen uiteindelijk de drie domeinen op te kopen en terug samen te brengen tot het originele Château Labégorce. Helaas overlijdt Hubert Perrodo plots door een ski-ongeluk in 2006. Echter, het jaar voor zijn ongeluk kocht de familie het derde van de drie domeinen waarmee het originele château hersteld zou zijn. Tegenwoordig produceert Château Labégorce twee wijnen: haar topwijn, vernoemd naar het château en een tweede wijn: Zédé de Labégorce. Niet te verwarren met de wijnen van Château Labégorce Zédé (ontstaan tijdens de splitsing van het originele domein) waarvan de productie na 2008 is gestaakt.